Type de diplôme : Master (LMD)

Master bioinformatique (M1) parcours Biologie informatique - Ingénierie de plateforme en biologie

Domaine : Sciences, Technologies, Santé

Mention: Bio-informatique

  • Niveau d'études visé

    BAC +5
  • Composante(s)

Présentation

Le M1 BI-IPFB est une nouvelle formation solide et interdisciplinaire, à l’interface de la biologie et de l’informatique, dotant les étudiants de compétences indispensables pour proposer des solutions innovantes afin de traiter des projets en relation avec la bioinformatique et les plates-formes en biologie.

La double compétence apportée par le M1 BI-IPFB répond aux besoins actuels des recruteurs et constitue le socle indispensable aux deux parcours de Master 2, M2 BI et M2 IPFB.

Objectifs

  • Connaissances en biologie et en bio-informatique
  • Capacité à comprendre une problématique biologique et à maîtriser des technologies d’exploration du vivant produisant des données massives.
  • Capacité à utiliser et à développer des méthodes et outils logiciels dédiés à l’exploration informatique des données du vivant
  • Aptitude à communiquer
  • Maîtrise de l’anglais

Savoir-faire et compétences

  • Concevoir des solutions méthodologiques et scientifiques en incluant l’analyse et la synthèse des informations scientifiques, techniques, opérationnelles et interdisciplinaires
  • Définir un plan expérimental et un plan d’analyse des données pour l’aboutissement les projets de recherche et développement
  • Utiliser des logiciels de bioinformatique, déployer des bases de données et des services web et manipuler les approches biostatistiques de base pour exploiter et interpréter les données du vivant
  • Utiliser des appareillages scientifiques de pointe pour répondre aux problématiques dans un des domaines tels que l’imagerie, la cytométrie, la génomique, la transcriptomique, la protéomique, les productions à grandes échelles
  • Savoir communiquer en anglais

Rythme de la formation Cours en semaine (journée)

Précision du rythme

Cours en semaine pour la formation initiale

Calendrier de l'alternance pour la formation en apprentissage

Niveau d'études viséBAC +5

Niveau d'entréeBac+3

Régime d'étude

  • Formation continue
  • Formation initiale
  • Formation continue non diplômante
  • Formation en alternance

Public(s) cible(s)

  • Étudiant
  • Salarié - Profession libérale
  • Apprenti - Alternant
  • Demandeur d’emploi
  • Responsable entreprise

Formation à distanceNon

Nature de la formationDiplôme

StageObligatoire

  • Validation des Acquis de l'Expérience : Oui
  • Capacité d'accueil

    25

    Organisation

    Organisation de la formation

    Formation :

    S1 :

    Bases de Unix et R (mise à niveau, 25h si nécessaire)

    Fondamentaux: Biochimie et UE à choisir parmi : Biostatistiques et programmation R ou Projet tuteuré en biostatistique et R

    Programmation et outils Mathématiques: 2 ou 3 UE à choisir parmi : Optimisation et apprentissage en biologie, Programmation Python 1 ou 2, Algorithmique 1 ou 2, Mathématiques 1, Projets tuteurés 1 ou 2, UE libre UE ou choix majeure informatique

    Pratique et approfondissement: Anglais et 1 ou 2 UE à choisir parmi : Stage 1 et préparation tuteurée, Stage 2, Projet tuteuré-majeure biologie ou informatique, UE majeure informatique, Programmation avancée, Bases de données, UE majeure biologie

    Orientation thématique I: Biologie innovante et Bio-informatiquede base

     

     

    S2 :

    Fondamentaux avancés : Analyse de données massives et Biophysique des interactions

    Orientation thématique II : 5 ou 6 enseignements à choisir parmi : Bioinformatique structurale, Dynamique des macromolécules, Omiques 1, Interactions moléculaires dans les milieux

    biologiques, Traitement du signal, Programmation web, Traitement d’images, Stabilité des génomes et des épigénomes, Projets tuteurés Rosalind, Génétique des Populations, Génomique et évolution bactérienne et virale, UE à choix majeure informatique 2, UE choix parcours ISDD-macromolécules, UE Choix libre 2, Stage 3

    UE Professionnalisation I : Stage 4

     

    Stages

    Stage en alternance pour la formation en apprentissage

    Stage de 3 mois en formation initiale

    Contrôle des connaissances

    Contrôle des connaissances : Contrôle continu et examen

    Admission

    Sont autorisés à s'inscrire

    Titulaires de : Licence de Biologie - Informatique, licence de Bioinformatique, licence de biologie / biochimie / biologie moléculaire, licence Sciences de la Vie/ du Vivant, Licence Sciences Biomédicales, Licence Informatique, Licence Chimie, Licence Chimie-Physique

    Conditions d'admission

    Connaissances fondamentales dans les disciplines: Biologie structurale, Biologie moléculaire et cellulaire, Biostatistiques, Bioinformatique et/ou Programmation et Algorithmique.

    Pré-requis

    Très bon niveau dans les enseignements de biologie structurale, biologie moléculaire et cellulaire, bioinformatique. Bon niveau en biostatistiques  ou très bon niveau en programmation et algorithmique.

    Niveau confirmé en français (C1) , anglais courant et connaissances de l'anglais scientifique, motivation du candidat

    Candidater / S'inscrire

    Référentiels

    Fiches métiers ROME

    • K2402: Recherche en sciences de l'univers, de la matière et du vivant

    Contact(s)

    Composante(s)

    Lieu(x) de la formation

    • Université Paris Diderot
    • Veronique Liebe-Gruber

      Responsable de la spécialité

      Tél : 01 69 15 33 94

      Email : veronique.gruber @ univ-paris-diderot.fr

      Catherine Etchebest

      Tél : 0144493058Fax : 0143263830

      Email : catherine.etchebest @ univ-paris-diderot.fr

      Gautier Moroy

      Tél : 0157278385

      Email : gautier.moroy @ univ-paris-diderot.fr

      Jean-Christophe Gelly

      Tél : 0158415168

      Email : jean-christophe.gelly @ univ-paris-diderot.fr

      Pierre Bourdoncle

      Coordinateur pédagogique

      Tél : 01 40 51 13 94

      Email : pierre.bourdoncle @ inserm.fr

    Contact(s) administratif(s)

    • Magali Jeanson

      Responsable de la Scolarité

      Université Paris Diderot UFR Sciences du vivant 35 rue Hélène Brion Bâtiment Lamarck B RH 4475013 PARISTél : 0157278230

      Email : magali.jeanson @ univ-paris-diderot.fr

    Contact(s) Formation Continue

    • Francoise Peuvion-Chalaux

      Tél : 0157278234

      Email : fcsdv @ univ-paris-diderot.fr

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